Vuoksenniskan koulukeskuksessa annetaan perusopetusta Vuoksenniskalla luokille 1-9 ja Kaukopäässä luokille 1-6. sekä Virasojan koulun luokille kahdessa toimipisteessä; 1.-2.-luokat Vuoksenniskalla ja 3.-6.-luokat Mansikkalan moduuleilla.
Vuoksenniskalla toimivat erityisryhmät: pidennetyn oppivelvollisuuden ryhmät, tukiluokka sekä JOPO-luokka (Joustava perusopetus).
Iltapäivisin on koululaisten iltapäivätoimintaa 1.-2.-luokille ja pidennetyn oppivelvollisuuden erityisluokkien oppilaille.
Yläluokilla noudatetaan 5-jaksojärjestelmää, mikä tarkoittaa sitä, että oppilaan lukujärjestys muuttuu noin joka 9. viikko. Yhteisistä opettajista johtuen lukujärjestys saattaa muuttua myös alaluokkien oppilailla. Yläluokilla oppiaineiden tuntimäärät eri oppiaineissa ja viikkotuntimäärä eri jaksoissa voivat vaihdella. Oppitunnit voivat olla yksittäisiä tunteja tai kaksoistunteja, taitoaineissa myös kolmoistunteja. Opetuksellisten ja muiden käytännön syiden vuoksi monien oppiaineiden tunnit on sijoitettu kuitenkin hajautetusti läpi vuoden, jolloin oppiainetta on sama tuntimäärä läpi lukuvuoden.
